莱顿大学没有中央校园；所有建筑散布在城市各处。有些建筑年代非常久远，例如Gravensteen (现为莱顿的国际办公室)；如Lipsius以及Gorlaeus。莱顿大学共分为9大学院，50多个系所，150多个专业与超过100个以上的研究所。
莱顿大学的九大学院分别是：
哲学院
医学院
法学院
宗教学院
考古学院
人文学院
数学与自然科学院
社会学与行为科学院
创作及表演艺术学院
创作及表演艺术学院是由莱顿大学、Royal Conservatory以及Royal Academy for Art合作创建的。该大学没有经济学、商学与管理学院。然而，2002年创立了莱顿管理学校(LUSM)，提供6个专业MBA课程。此课程只维持四年，也就是2006年所有管理课程都被取消。然而莱顿管理学校发展了其他商业管理活动，使得他们与大学内的学院关系更密切。他们与数学学院合作提供理学硕士学位：商业信息通信技术专业。
